¿Cómo se desarrollaría de manera diferente una sociedad humana si estuviera atrapada durante tres mil años en una caverna subterránea, con acceso al océano, pero solo por debajo del nivel del mar (sin acceso a la superficie del océano)?

Asumamos algunas cosas, como lo mencionaron otros respondedores. Hay suficiente aire, el grupo atrapado en la caverna ya era un grupo con conocimiento de supervivencia que tenía un par de artilugios que les permitían recolectar agua y hacerla segura (y cualesquiera que sean esos artilugios, pueden ser alimentados o reproducidos hasta el infinito) , la presión no es demasiado alta por estar bajo el agua, es una gran caverna.

Ahora, ¿por qué 3.000 años? ¿Querías tiempo suficiente para la mutación? No creo que se pueda obtener suficiente población para obtener una mutación suficiente que les permita sobrevivir 3.000 años. Dudo que vivan 50 años a menos que haya mucho acceso a agua dulce y alimentos. Tendrías que asumir que cualquiera querría estar cerca de alguien en lugares cerrados durante tanto tiempo, tener hijos y nietos y ser capaz de cuidar y alimentar a esos jóvenes hasta que puedan ayudar lo suficiente como para que tener hijos sea ventajoso (ellos realmente tendría que pensar de esa manera).

Además, tendrían que tener la voluntad de querer continuar. Los tienes yendo durante 3.000 años, pero tienen que estar pensando más cerca o no pensar en nada más allá de un rescate o probablemente no vencerían la depresión y cualquier suicidio reduciría la capacidad del grupo de continuar sobreviviendo.

Si se trata de una historia, te sugiero que no lo hagas para que no haya acceso a la superficie, hazlo difícil, pero no imposible. Puede agregar una mutación forzada para que las personas puedan bucear y permanecer bajo el agua durante largos períodos: permanecer en una caverna de cualquier tamaño durante un período prolongado tiene demasiados inconvenientes durante un período tan largo.