¿Es el superyó una enfermedad?

No.
¿Conoces a alguien autorrealizado que no llegue a ese punto sin usar su superyó? Podría ser. Pero la mayoría de las personas se realizan a través de su ego.
El ego viene con el superyó: el superyó es el conjunto de objetivos y el ego es parte de la voluntad, la libido, que se dirige hacia los objetivos.
Usted dice: ¿la naturaleza inhibitoria destructiva del superyó no se convierte en el mayor obstáculo para la autorrealización?
Su naturaleza no es destructiva, podría usarse de manera muy creativa. Para algunas personas podría ser el único combustible que tienen.
En su pregunta, la autorrealización es parte de su superyó. Ya ves, dices “¿No es un obstáculo?”: El superyó es la totalidad de tus objetivos y si la autorrealización es tu objetivo, entonces tu superyó te está apoyando hacia él.
Mientras haya objetivos, lucharás por ellos. Pero si tu camino es el de los objetivos, entonces continúas, en cierto punto tal vez no encuentres objetivos a los que disparar.