¿Cuáles son algunos de los mejores directores cuyas películas son una clase aparte?

Sin ningún orden en particular (y recuerde, usted pidió directores idiosincrásicos, no consistentes, o necesariamente de buen gusto):
Preston Sturges (La Señora Eva, Milagro de Morgan’s Creek, Palm Beach Story)
Billy Wilder (Sunset Blvd., doble indemnización)
Samuel Fuller (Beso Desnudo, Corredor De Choque)
Terry Gilliam (Bandidos del tiempo, 12 monos, el rey pescador)
Roman Polanski (El Arrendatario, Chinatown)
David Lynch (Terciopelo azul, Mulholland Dr.)
Alfonso Cuarón (Harry Potter y el prisionero de Azkaban, Hijos de los hombres, gravedad)
Werner Herzog (Enigma de Kaspar Hauser, Grizzly Man y muchos más)
Rainer Werner Fassbinder (Matrimonio de Maria Braun, Berlin Alexanderplatz)
Russ Meyer (Más allá del valle de las muñecas, ¡Matar a gatito más rápido!)
Kathryn Bigelow (Días Extraños, Cero Oscuro Treinta)
Takashi Miike (Audition, Ichi the Killer)
Orson Welles (Touch of Evil, Lady de Shanghai)
Abel Ferrara (teniente malo)
David Cronenberg (Dead Ringers, Spider)
John Cassavettes (Maridos, Una mujer bajo la influencia)
Ingmar Bergman (Fanny y Alexander, gritos y susurros)
Federico Fellini (Roma, Amarcord)
Peter Weir (La última ola, El show de Truman)
Dario Argento (Suspiria, El pájaro con el plumaje de cristal)
Stephen Frears (relaciones peligrosas, alta fidelidad, The Grifters)
Ken Russell (Los demonios, estados alterados)
Paul Thomas Anderson (Magnolia, Hard Eight)
Sergio Leone (El bueno, el malo y el feo, érase una vez en el oeste)
Los hermanos Coen (True Grit, Fargo …)
… Y Terence Malick (El Nuevo Mundo, Días del Cielo) –¡gracias Ken Fishkin!

Christopher Nolan por supuesto (en la era moderna)
Sus películas están en un nivel completamente diferente cuando se trata de filmografía, argumento o diálogos … todo está casi perfecto.

Danny Boyle
Películas como 127 Hours, slumdog millionaire eran ciertamente diferentes de las películas de culto.

Respuesta fácil: Kubrick.

Darren Aronofsky.
Pi, The Fountain, Réquiem por un sueño, Black Swan: ¡Perturbador, pero una clase aparte!